土壤不僅是有機污染物的載體，也是植物生長的基本載體。土壤質量優(yōu)劣直接影響植物生長狀況，這必然會在植物修復效果中有所反應。以植物對有機污染物的直接吸收為例，其吸收作用取決于植物對污染物的吸收效率和植物生物量；吸收效率與植物、污染物固有性質有關，而生物量則取決于土壤的理化性質。
 
土壤理化性質對植物吸收污染物具有顯著影響。土壤顆粒組成直接關系到土壤顆粒比表面積的大小，影響其對有機污染物的吸附能力，從而影響污染物的生物可利用性。土壤酸堿性不同，其吸附有機物的能力也不同。
 
堿性條件下，土壤中部分腐殖質由螺旋態(tài)轉變?yōu)榫€形態(tài)，提供了更豐富的結合位點，降低了有機污染物的生物可利用性；相反，當pH<6．0時，土壤顆粒吸附的有機污染物可重新回到土壤水溶液中，隨植物根系吸收進人植物體。另外土壤性質的變化，直接影響植物的生長狀況，從而影響植物修復的效率。土壤中礦物質和有機質的含量是影響植物土壤修復有機污染物的兩個重要因素。礦物質含量高的土壤對離子性有機污染物吸附能力較強，有機質含量高的土壤會吸附或固定大量的疏水性有機物，降低其生物可利用性。植物主要從土壤水溶液中吸收污染物，土壤水分能抑制土壤顆粒對污染物的表面吸附能力，促進其生物可利用性；但土壤水分過多，處于淹水狀態(tài)時，會因根際氧分不足，而減弱對污染物降解能力。